Le microbiote intestinal : cet acteur-clé de notre santé

Publié le 20/03/2025

Depuis quelques années, le microbiote intestinal est devenu un sujet incontournable en santé. Jadis ignoré, il est aujourd’hui au cœur de nombreuses recherches et suscite un engouement médiatique grandissant. Mais pourquoi cet intérêt soudain ? Est-ce un effet de mode ou une véritable révolution scientifique ?

Julien Scanzi, hépato-gastroentérologue à l’hôpital de Thiers et au CHU de Clermont-Ferrand, nous apporte son expertise sur ce sujet, aux côtés de Lucile Manteau, directrice médicale d’Effiscience, lors d’un échange animé par Julia Molkhou dans le podcast Effivox, La Voix de la Com’ Santé.

Julien Scanzi rappelle que si l’on parle tant du microbiote aujourd’hui, c’est avant tout grâce aux progrès technologiques : « Les outils de séquençage à haut débit n’existent que depuis 15 à 20 ans. Avant cela, nous ne pouvions pas étudier l’ensemble des micro-organismes ». Ces avancées permettent désormais de comprendre l’importance de cet écosystème qui comprend environ 40 000 milliards de bactéries et autres micro-organismes vivant en symbiose avec notre organisme.

Ce regain d’intérêt se traduit aussi par une explosion du nombre de publications scientifiques. Lucile Manteau illustre ce point : « En 2023, 21 500 publications ont porté sur le microbiote contre seulement 197 en 2003 ». Cette croissance exponentielle témoigne de la montée en puissance du sujet dans la communauté scientifique.

L’une des découvertes majeures récentes est l’impact du microbiote sur un large éventail de maladies. Longtemps associé uniquement aux troubles digestifs comme la maladie de Crohn, le microbiote intestinal joue en réalité un rôle bien plus vaste.

Julien Scanzi explique : « Le microbiote est en lien avec notre santé globale : maladies inflammatoires, métaboliques, mais aussi santé mentale avec l’anxiété et la dépression ». Plus surprenant encore, il pourrait être un prédicteur de la réponse à certains traitements, notamment en oncologie. Des études menées à l’institut Gustave Roussy montrent que la composition du microbiote influence la réponse à l’immunothérapie dans certains cancers.

Face à cette prise de conscience, une question se pose : pouvons-nous modifier notre microbiote pour améliorer notre santé ? La réponse est nuancée.

Selon Julien Scanzi, « on peut moduler son microbiote par l’alimentation, les prébiotiques, les probiotiques, mais le modifier complètement n’est possible qu’avec une transplantation de microbiote fécal ». Cette technique consiste à transplanter le microbiote d’un individu sain à un patient malade, et bien que prometteuse, elle reste encore encadrée et limitée à certaines indications.

Dans un marché en pleine expansion, différencier ces produits devient essentiel. Julien Scanzi clarifie les termes :

• Prébiotiques : « Ce sont des substrats qui nourrissent les ‘bonnes’ bactéries intestinales, entraînant un bénéfice pour la santé ».
• Probiotiques : « Ce sont des micro-organismes vivants ayant un effet bénéfique pour la santé ».
• Postbiotiques : « Ce sont des micro-organismes inactivés qui conservent un effet positif ».

Cependant, tous les probiotiques ne se valent pas. Lucile Manteau insiste sur la nécessité de se baser sur la science : « Nous devons nous appuyer sur des études pour savoir quelle souche est efficace pour quelle indication ».

Le rôle de la communication santé est essentiel pour informer le public et les professionnels. Longtemps en retard sur d’autres pays européens comme l’Italie ou l’Espagne, la France n’a autorisé l’usage du terme « probiotique » qu’en 2023 : « Avant, nous ne pouvions pas employer le mot « probiotique » sur les boites des compléments alimentaires en France », souligne Lucile Manteau. Cette reconnaissance permet une meilleure transparence, mais nécessite également une vigilance accrue pour distinguer les produits ayant un réel effet de ceux relevant de la simple revendication marketing.

L’essor des recherches sur le microbiote intestinal ouvre des perspectives fascinantes en santé. Son implication dans de nombreuses pathologies et son rôle potentiel en tant que biomarqueur rendent ce domaine incontournable. Mais pour que ces avancées profitent pleinement aux patients, il est essentiel d’améliorer la formation des professionnels de santé et de renforcer la communication sur ce sujet. Côté grand public, nous pouvons d’ores et déjà agir en adoptant une alimentation riche en fibres et en préservant notre microbiote au quotidien. L’avenir de la médecine pourrait bien se jouer dans nos intestins.

Pour découvrir l’interview dans son intégralité : accédez ici à l’épisode N°3 du podcast Effivox, La Voix de la Com’ Santé.

Le Docteur Julien Scanzi est un Hépato-Gastroentérologue au Centre Hospitalier de Thiers et au CHU de Clermont-Ferrand, spécialisé dans les maladies intestinales et dans la transplantation de microbiote fécal. Outre ses activités de soin et de recherche, il est aussi conférencier et auteur de 2 livres grand public sur le microbiote intestinal :

• Incroyable microbiote ! Voyage au cœur des étonnants pouvoirs de l’intestin. Éditions Leduc 2022.
• L’alimentation – Incroyable microbiote ! Les clés pour bien nourrir votre intestin.  Éditions Leduc 2024